Funktionsstörungen im PSNS können vielfältig sein und nur ein oder mehrere Organe betreffen. Wenn die Nerven im System beschädigt sind, kann dies die Übermittlung von Nachrichten zwischen Gehirn und Organen wie Herz, Blutgefäßen und Schweißdrüsen stören. Ein Überschuss des Neurotransmitters Acetylcholin kann einige Nebenwirkungen verursachen.
Da dieser Neurotransmitter Signale an Organe des Körpers sendet, die am PSNS beteiligt sind, kann ein Überschuss zu Krämpfen, Muskelschwäche, Lähmungen, Durchfall, verschwommenem Sehen und Überproduktion von Tränen führen. Wenn das PSNS aufgrund von Nervenschäden unteraktiv ist, können Symptome wie ständig hoher Blutdruck und Herzfrequenz auftreten.
Dies liegt daran, dass das parasympathische Nervensystem nicht richtig funktionieren kann, um den Körper nach Stressphasen zu beruhigen, sodass jemand sich ständig in einem Stresszustand befinden kann, obwohl kein sichtbarer Auslöser vorliegt. Autonome Dysfunktion ist ein Zustand, bei dem das autonome Nervensystem und seine Unterteilungen nicht richtig arbeiten. Diese Dysfunktion kann entstehen, wenn Nerven des autonomen Nervensystems beschädigt sind, und kann von mild bis lebensbedrohlich reichen. Die häufigste Ursache für autonome Dysfunktion ist Diabetes, aber es kann auch erblich bedingt sein, ebenso wie Alterung, Parkinson-Krankheit oder chronisches Erschöpfungssyndrom einige der möglichen Ursachen sind.

Nachfolgend sind einige weitere Symptome von Schäden oder Funktionsstörungen im PSNS aufgeführt:

• Probleme bei der Verdauung von Nahrung – nicht in der Lage zu sein, richtig oder langsamer als normal zu verdauen.
• Blasenfunktionsstörung – dies kann zu Harninkontinenz führen.
• Abnormales Schwitzen – die Schweißdrüsen können zu viel oder zu wenig Schweiß produzieren.
• Fehlende Pupillenreaktion – die Pupillen können sich nach einer stressigen Situation nicht verengen und erscheinen daher möglicherweise immer größer als normal.
• Mangel an Speichelfluss – dies kann dazu führen, dass Nahrung nicht richtig verdaut wird.
• Schlecht Gewohnheitsmenü
• Darmprobleme – dies kann entweder Verstopfung oder zu häufige Stuhlentleerungen sein.
• Unfähigkeit, die innere Körpertemperatur zu kontrollieren.
• Sehprobleme, z. B. verschwommenes Sehen.

Die autonome Dysfunktion kann je nach den erlebten Symptomen behandelt werden. Wenn die Ursache der Dysfunktion beispielsweise Diabetes ist, wird die Kontrolle des Blutzuckers die Hauptbehandlung sein. In vielen Fällen kann die Behandlung der Grunderkrankung (falls zutreffend) es den geschädigten Nerven im ANS ermöglichen, sich zu reparieren und zu regenerieren. Eine autonome Dysfunktion kann von einem Arzt diagnostiziert werden, der sich Zeit nimmt, um genau zu verstehen, worin das Problem besteht. Zum Beispiel durch die Verwendung von Blutdruckmessgeräten zur Überprüfung von hohem oder niedrigem Blutdruck oder durch ein Elektrokardiogramm zur Messung der Herzfrequenz.
Obwohl medizinische Zustände nicht immer behandelt werden können, gibt es einige schnelle Lösungen, die nützlich sein können, um das PSNS zu aktivieren, wenn die Erholung von einer stressigen Situation länger dauert. Zum Beispiel kann tiefes Bauchatmen helfen, das PSNS zurückzusetzen und die Herzfrequenz zu senken. Ebenso haben Aktivitäten wie Achtsamkeit, Meditation und Yoga gezeigt, dass sie zur Entspannung beitragen und sogar helfen können, den Körper zur Homöostase zurückzuführen. Bei schwerwiegender parasympathischer Dysfunktion wird immer empfohlen, einen Arzt zu konsultieren.