Las disfunciones dentro del PSNS pueden ser variadas y pueden afectar solo a uno o más órganos. Si los nervios del sistema están dañados, esto puede interferir con los mensajes enviados entre el cerebro y órganos como el corazón, los vasos sanguíneos y las glándulas sudoríparas. Si hay un exceso del neurotransmisor acetilcolina, esto puede causar algunos efectos secundarios.
Como este neurotransmisor envía señales a los órganos del cuerpo involucrados en el PSNS, un exceso de este puede resultar en calambres, debilidad muscular, parálisis, diarrea, visión borrosa y sobreproducción de lágrimas. Si el PSNS está poco activo debido a daño nervioso, esto podría resultar en síntomas como presión arterial y frecuencia cardíaca constantemente altas.
Esto se debe a que el sistema parasimpático no puede funcionar correctamente para calmar el cuerpo después de momentos de estrés, por lo que puede encontrarse a alguien en un estado constante de estrés cuando no hay un desencadenante visible. La disfunción autonómica es una condición en la que el sistema nervioso autónomo y sus divisiones no funcionan correctamente. Esta disfunción puede desarrollarse cuando los nervios del sistema nervioso autónomo están dañados y puede variar desde leve hasta potencialmente mortal. La causa más común de disfunción autonómica es la diabetes, pero también puede haber razones hereditarias, así como envejecimiento, enfermedad de Parkinson o síndrome de fatiga crónica, siendo algunas de las posibles causas.

A continuación, algunos otros síntomas de daño o disfunción dentro del PSNS:

• Problemas para digerir los alimentos: no poder digerir adecuadamente o a un ritmo más lento de lo normal.
• Disfunción de la vejiga: esto podría resultar en incontinencia urinaria.
• Sudoración anormal: las glándulas sudoríparas pueden estar produciendo demasiado o muy poco sudor.
• Falta de respuesta pupilar: las pupilas pueden no ser capaces de contraerse después de una situación estresante, por lo que pueden parecer siempre más grandes de lo normal.
• Falta de salivación: esto puede resultar en que los alimentos no se digieran correctamente.
• Malo menú de hábitos
• Problemas intestinales: esto podría ser estreñimiento o demasiadas evacuaciones.
• Incapacidad para controlar la temperatura interna del cuerpo.
• Problemas visuales, por ejemplo, visión borrosa.

La disfunción autonómica puede tratarse según los síntomas que se experimenten. Por ejemplo, si la causa de la disfunción es la diabetes, controlar los niveles de azúcar en sangre será el tratamiento principal. En muchos casos, el tratamiento de la enfermedad subyacente (si aplica) puede permitir que los nervios dañados dentro del SNA se reparen y regeneren. La disfunción autonómica puede diagnosticarse mediante un médico que se tome el tiempo para entender exactamente cuál es el problema. Por ejemplo, usando monitores de presión arterial para medir presión alta o baja, o un electrocardiograma para medir la frecuencia cardíaca.
Aunque las condiciones médicas no siempre pueden tratarse, existen algunas soluciones rápidas que pueden ser útiles para activar el SPS si la recuperación de una situación estresante tarda en llegar. Por ejemplo, tomar respiraciones profundas abdominales puede ayudar a reiniciar el SPS y reducir la frecuencia cardíaca. De manera similar, actividades como la atención plena, la meditación y el yoga han demostrado ayudar a relajarse e incluso podrían ayudar al cuerpo a volver a la homeostasis. Para disfunciones parasimpáticas más graves, siempre se recomienda consultar a un médico.